Исследовательская группа

BioLabs

Материалы

Publications what-where-when

11 июля 2020 г.

Олег Шпынов

Publications what-where-when

Snakemake advanced tutorial

6 мая 2020 г.

Роман Чернятчик

Snakemake advanced tutorial

Анализ данных ChIP-seq: от гистонов к информатическим задачам

20 февраля 2020 г.

Олег Шпынов

Анализ данных ChIP-seq: от гистонов к информатическим задачам

Epigenetic regulation

13 февраля 2020 г.

Олег Шпынов, Роман Чернятчик

ChromHMM and DNA methylation

Regulation of transcription

Mathematics in Biology

5 февраля 2020 г.

Олег Шпынов

Mathematics in Biology

57-fold Throughput Increase and Other Incredible Stories of Native Optimization

10 декабря 2019 г.

Алексей Диевский

57-fold Throughput Increase and Other Incredible Stories of Native Optimization

ChIP-Seq processing with snakemake

1 августа 2019 г.

Роман Чернятчик

ChIP-Seq processing with snakemake

Epigenetic regulation and aging

31 июля 2019 г.

Олег Шпынов

Epigenetic regulation and aging

Causal Inference Review

27 июня 2019 г.

Олег Шпынов

Causal Inference Review

Snakemake Workshop

29 мая 2019 г.

Алексей Диевский

Snakemake Workshop

Introduction to DNA Methylation

24 апреля 2019 г.

Роман Чернятчик

Introduction to DNA Methylation

Epigenetics analysis practice

23 апреля 2019 г.

Олег Шпынов, Роман Чернятчик

Epigenetics analysis practice

Single cell ATAC-Seq processing review

16 января 2019 г.

Алексей Диевский

Single cell ATAC-Seq processing review

Snakemake Overview

14 января 2019 г.

Алексей Диевский

Snakemake Overview

NeurIPS 2018 summary

19 декабря 2018 г.

Олег Шпынов

NeurIPS 2018 summary

Biata2018 summary

30 июля 2018 г.

Петр Цуринов

Biata2018 summary slides

Talk at Bioinformatics Institute Summer School 2018

28 июля 2018 г.

Олег Шпынов

ChIP-Seq - method for studying epigenetic mechanisms

Talk at JetBrains internal conference

13 апреля 2018 г.

Олег Шпынов

JetBrains Research and Aging Studies - What's This All About?

Rule mining and information theory

16 ноября 2016 г.

Олег Шпынов

RM and information

Pipeline for epigenomic profiling of several histone marks in aging monocytes

20 октября 2016 г.

Олег Шпынов

Pipeline for epigenomic profiling of several histone marks in aging monocytes

Tensor Methods in Machine Learning

6 июня 2016 г.

Евгений Курбацкий

Tensor Methods in Machine Learning

Rule mining and counter examples

13 апреля 2016 г.

Олег Шпынов

Rule mining and counter examples

Predicting TSS using Deep Learning

6 апреля 2016 г.

Евгений Курбацкий

Predicting TSS using Deep Learning

NIPS 2015

12 января 2016 г.

Евгений Курбацкий

NIPS 2015

Talk at Bioinformatics Institute

11 ноября 2015 г.

Олег Шпынов

Talk at Bioinformatics Institute

RuleMining2

30 сентября 2015 г.

Олег Шпынов

RuleMining2

Models comparison

25 сентября 2015 г.

Евгений Курбацкий

Models comparison

Talk at Almazov center

22 июля 2015 г.

Олег Шпынов

Talk at Almazov center

Rule Mininig Applications

20 марта 2015 г.

Олег Шпынов

Rule Mininig Applications

Mathematical methods compendium

18 марта 2015 г.

Алексей Диевский

Mathematical methods compendium

Rule Mininig

19 ноября 2014 г.

Олег Шпынов

Rule Mininig

Small RNAs. Micro RNA mechanism review

31 октября 2014 г.

Роман Чернятчик

Small RNAs. Micro RNA mechanism review.

Review on epigenetics and differentiation

29 октября 2014 г.

Олег Шпынов

Review on epigenetics and differentiation

NMF applications for ChIPSeq data. Updated

1 сентября 2014 г.

Олег Шпынов

NMF applications for ChIPSeq data. Updated

Bins

27 августа 2014 г.

Анна Атаманова

Bins

NMF applications for ChIPSeq data

17 июля 2014 г.

Олег Шпынов

NMF applications for ChIPSeq data

RNA-Seq Bias Correction

10 апреля 2014 г.

Роман Чернятчик

RNA-Seq Bias Correction

RNA-Seq Differential Expression methods evolution

27 февраля 2014 г.

Роман Чернятчик

RNA-Seq Differential Expression methods evolution

Discovery and characterization of chromatin states for systematic annotation of the human genome

12 февраля 2014 г.

Олег Шпынов

Discovery and characterization of chromatin states for systematic annotation of the human genome

Chip-Seq analysis

31 января 2014 г.

Евгений Курбацкий

Chip-Seq analysis

Locus-specific editing of histone modifications at endogenous enhancers

22 января 2014 г.

Олег Шпынов

Locus-specific editing of histone modifications at endogenous enhancers

Epigenetic editing

11 декабря 2013 г.

Олег Шпынов

Epigenetic editing

Dynamic and Coordinated Epigenetic Regulation of Developmental Transitions in the Cardiac Lineage

29 ноября 2013 г.

Евгений Курбацкий

Dynamic and Coordinated Epigenetic Regulation of Developmental Transitions in the Cardiac Lineage

IMB Topics #2

22 ноября 2013 г.

Олег Шпынов

IMB Topics #2

Cufflinks

13 ноября 2013 г.

Евгений Курбацкий

Cufflinks

IMB Topics: Regulation of the Stem Cell State

6 ноября 2013 г.

Роман Чернятчик

IMB Topics: Regulation of the Stem Cell State

Information criteria

28 октября 2013 г.

Диевский Алексей

Information criteria

DNA Methylation Models

23 октября 2013 г.

Лебедев Сергей

DNA Methylation Models

Bayesian Networks

14 октября 2013 г.

Диевский Алексей

Bayesian Networks

Yandex School of Data Analysis

7 октября 2013 г.

Шпынов Олег

Yandex School of Data Analysis

Dynamic Regulation of Nucleosome Positioning in the Human Genome

4 апреля 2013 г.

Роман Чернятчик

Dynamic Regulation of Nucleosome Positioning in the Human Genome

DNA methylation effect on co-transcriptional splicing is dependent on GC-architecture of the exon-intron structure

2 апреля 2013 г.

Роман Чернятчик

DNA methylation effect on co-transcriptional splicing is dependent on GC-architecture of the exon-intron structure

JetPoint Meeting

6 марта 2013 г.

Шпынов Олег

JetPoint Meeting