Исследовательская группа

Прикладное машинное обучение и глубокое обучение

Предсказание структуры CDR-H3 с помощью методов глубокого обучения

May 25

Антитела – белковые соединения предназначенные для нейтрализации клеток патогенов. Информация о структуре антител широко используется в белковой инженерии антител, изучении их способности к связыванию антигенов. Для этого требуется создать алгоритм, способный по белковой последовательности предсказывать форму антитела. В состав антитела входят тяжелые и легкие цепи. Самая вариативная из них 3й CDR тяжелой цепи, остальные участки цепи могут быть предсказаны консервативными методами. Цепь - последовательность аминокислотных остатков. Для каждого аминокислотного остатка необходимо предсказать координаты 3х атомов C, C-Alpha и N (чтобы предсказать backbone). 
На семинаре будет представлен метод предсказания структуры CDR-H3 с помощью глубокого обучения, будет рассмотрено применение модели CharRNN к текущей задаче, а также проблемы реализации и способы их решения.

Докладчик: Орлова Александра.

Язык доклада: русский.

Дата и время:  25 мая, 18:30.

https://us02web.zoom.us/j/217320533?pwd=TzllQzNld1ExUVJUdENXdzZsblBhUT09

Meeting ID: 217 320 533

Passcode: 021675