Роман Чернятчик

Роман Чернятчик


Исследовательские группы

Биография

Выпускник кафедры системного программирования математико-механического факультета СПбГУ. В 2012 году закончил годичные курсы по биоинформатике при СПбАУ РАН.

2012 — по н.в. Исследователь в BioLabs. Занимается изучением эпигенетических процессов в человеческом организме. Особенно интересуется механизмами метелирования и деметилирования, а также их связью с некодирующими РНК и гистонными модификациями.

2006—2012 Один из основателей проекта RubyMine. Участвовал в создании и других проектов JetBrains, таких как IntelliJ IDEA или TeamCity.

2005—2006 Разработчик в проекте Apache Harmony.

2005—2008 Участник ряда проектов, связанных с DSL и Visual Modeling.

Профессиональная активность

Участник многочисленных конференций, посвященных технологии Ruby on Rails.

Публикации

SPAN and JBR: analysis and visualization toolkit for peak calling

August 2021

Oleg Shpynov , Roman Chernyatchik, Petr Tsurinov, Maxim Artyomov

BCB '21: Proceedings of the 12th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics, Article No.: 69, Pages 1

Подробнее

Semi-supervised peak calling with SPAN and JBR Genome Browser

May 2021

Oleg Shpynov, Aleksei Dievskii, Roman Chernyatchik, Petr Tsurinov, Maxim N Artyomov

Bioinformatics, btab376

Подробнее

Enhanced epigenetic profiling of classical human monocytes reveals a specific signature of healthy aging in the DNA methylome

November 2020

Irina Shchukina, Juhi Bagaitkar, Oleg Shpynov, Ekaterina Loginicheva, Sofia Porter, Denis A. Mogilenko, Erica Wolin, Patrick Collins, German Demidov, Mykyta Artomov, Konstantin Zaitsev, Sviatoslav Sidorov, Christina Camell, Monika Bambouskova, Laura Arthur, Amanda Swain, Alexandra Panteleeva, Aleksei Dievskii, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov, Roman Chernyatchik, Vishwa Deep Dixit, Marko Jovanovic, Sheila A. Stewart, Mark J. Daly, Sergey Dmitriev, Eugene M. Oltz & Maxim N. Artyomov

Nature Aging

Подробнее

Epigenetic aging of classical monocytes from healthy individuals

May 2020

Irina Shchukina, Juhi Bagaitkar, Oleg Shpynov, Ekaterina Loginicheva, Sofia Porter, Denis A. Mogilenko, Erica Wolin, Patrick Collins, German Demidov, Mykyta Artomov, Konstantin Zaitsev, Sviatoslav Sidorov, Christina Camell, Monika Bambouskova, Laura Arthur, Amanda Swain, Alexandra Panteleeva, Aleksei Dievskii, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov, Roman Chernyatchik, Vishwa Deep Dixit, Marko Jovanovic, Sheila A. Stewart, Mark J. Daly, Sergey Dmitriev, Eugene M. Oltz, Maxim N. Artyomov

bioRxiv preprint

Подробнее

GENOMIC DATA ACCESS SERVICE

2019

Kalinin Vladislav Il'ich, Cherniatchik Roman Igorevich

ПРОЦЕССЫ УПРАВЛЕНИЯ И УСТОЙЧИВОСТЬ

Подробнее

POSTER: Semi-supervised solution for robust peak calling of Low Input ChIP-Seq

September 2018

Oleg Shpynov, Aleksei Dievskii, Roman Chernyatchik, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov and Maxim Artyomov

Proceedings of the 17th European conference on computational biology

Подробнее

POSTER: Semi-supervised solution for peak calling

July 2018

Oleg Shpynov, Aleksei Dievskii, Roman Chernyatchik, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov, Maxim N. Artyomov

Proceedings of Biata2018 Bioinformatics: from algorithms to applications

Подробнее