Роман Чернятчик
Исследовательские группы
Биография
Выпускник кафедры системного программирования математико-механического факультета СПбГУ. В 2012 году закончил годичные курсы по биоинформатике при СПбАУ РАН.
2012 — по н.в. Исследователь в BioLabs. Занимается изучением эпигенетических процессов в человеческом организме. Особенно интересуется механизмами метелирования и деметилирования, а также их связью с некодирующими РНК и гистонными модификациями.
2006—2012 Один из основателей проекта RubyMine. Участвовал в создании и других проектов JetBrains, таких как IntelliJ IDEA или TeamCity.
2005—2006 Разработчик в проекте Apache Harmony.
2005—2008 Участник ряда проектов, связанных с DSL и Visual Modeling.
Профессиональная активность
Участник многочисленных конференций, посвященных технологии Ruby on Rails.
Публикации
SPAN and JBR: analysis and visualization toolkit for peak calling
Август 2021
Oleg Shpynov , Roman Chernyatchik, Petr Tsurinov, Maxim Artyomov
Semi-supervised peak calling with SPAN and JBR Genome Browser
Май 2021
Oleg Shpynov, Aleksei Dievskii, Roman Chernyatchik, Petr Tsurinov, Maxim N Artyomov
Enhanced epigenetic profiling of classical human monocytes reveals a specific signature of healthy aging in the DNA methylome
Ноябрь 2020
Irina Shchukina, Juhi Bagaitkar, Oleg Shpynov, Ekaterina Loginicheva, Sofia Porter, Denis A. Mogilenko, Erica Wolin, Patrick Collins, German Demidov, Mykyta Artomov, Konstantin Zaitsev, Sviatoslav Sidorov, Christina Camell, Monika Bambouskova, Laura Arthur, Amanda Swain, Alexandra Panteleeva, Aleksei Dievskii, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov, Roman Chernyatchik, Vishwa Deep Dixit, Marko Jovanovic, Sheila A. Stewart, Mark J. Daly, Sergey Dmitriev, Eugene M. Oltz & Maxim N. Artyomov
Epigenetic aging of classical monocytes from healthy individuals
Май 2020
Irina Shchukina, Juhi Bagaitkar, Oleg Shpynov, Ekaterina Loginicheva, Sofia Porter, Denis A. Mogilenko, Erica Wolin, Patrick Collins, German Demidov, Mykyta Artomov, Konstantin Zaitsev, Sviatoslav Sidorov, Christina Camell, Monika Bambouskova, Laura Arthur, Amanda Swain, Alexandra Panteleeva, Aleksei Dievskii, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov, Roman Chernyatchik, Vishwa Deep Dixit, Marko Jovanovic, Sheila A. Stewart, Mark J. Daly, Sergey Dmitriev, Eugene M. Oltz, Maxim N. Artyomov
GENOMIC DATA ACCESS SERVICE
2019
Kalinin Vladislav Il'ich, Cherniatchik Roman Igorevich
POSTER: Semi-supervised solution for robust peak calling of Low Input ChIP-Seq
Сентябрь 2018
Oleg Shpynov, Aleksei Dievskii, Roman Chernyatchik, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov and Maxim Artyomov
POSTER: Semi-supervised solution for peak calling
Июль 2018
Oleg Shpynov, Aleksei Dievskii, Roman Chernyatchik, Evgeny Kurbatsky, Petr Tsurinov, Maxim N. Artyomov