Группа

Основными целями группы являются исследование механизмов эпигенетической регуляции у людей и других организмов, а также понимание роли этих механизмов в процессах клеточной дифференцировки и старения.

Группа входит в исследовательское подразделении компании JetBrains. Контактное лицо: Олег Шпынов.

Проекты

Инструменты

  • SPAN Peak Analyzer - полуавтоматический анализ пиков
  • JBR Genome Browser - быстрый и надежный геномный браузер с функцией разметки и анализа пиков
  • SnakeCharm - snakemake плагин для IntelliJ platform IDEs
  • Pubtrends - сервис для анализа публикаций

Исходный код

Github page - весь исходный код находится здесь.

Материалы

Materials - здесь находятся различные материалы, презентации итд.

Студенческая практика

Новости

More posts

Публикации

  • O. Shpynov, A. Dievskii, P. Tsurinov, et al
    Bioinformatics Institute 2018/19 project abstracts
    Saint-Petersburg, ISBN 978-5-6043094-2-1,
  • Jeremy P. Huynh, Chih-Chung Lin, Jacqueline M. Kimmey, Nicholas N. Jarjour, Elizabeth A. Schwarzkopf, Tara R. Bradstreet, Irina Shchukina, Oleg Shpynov, Casey T. Weaver, Reshma Taneja, Maxim N. Artyomov, Brian T. Edelson, Christina L. Stallings
    Journal of Experimental Medicine,