Олег Шпынов

Биография

Олег руководит группой бионформатики в лаборатории JetBrains Research. Работает в лаборатории с 2013 года.

В 2008 году с отличием окончил математико-механический факультет СПбГУ. В 2008-2010 гг. обучался в аспирантуре СПбГУ на математико-механическом факультете, кафедре системного программирования. Будучи профессиональным разработчиком программного обеспечения, принимал участие в разработке основных продуктов JetBrains, включая флагманский продукт IntellIJ IDEA, а также PyCharm. Создатель среды разработки Rubymine. Занимался анализом языков программирования начиная с лексического анализа, заканчивая разработкой систем типов и различных верификаций.

Олег интересуется биоинформатикой, машинным обучением, компиляторами и спортивным программированием. Увлекается путешествиями и походами, сноубордингом, дайвингом, велосипедным спортом и фотографией.

Подробнее: LinkedIn.

Профессиональная деятельность

  • Semi-supervised solution for robust peak calling of Low Input ChIP-Seq at ECCB 2018
  • Semi-supervised peak calling solution, a poster at Biata 2018: The Second Annual Scientific Conference, from algorithms to applications
  • Multi-omics dissection of Healthy Human Aging Focusing on CD14+/CD16- Monocytes, a poster at Keystone Symposia 2018: Aging, Inflammation and Immunity
  • Pipeline for epigenetic profiling of multiple histone marks in aging of monocytes, a poster at Immunology Program Retreat at Washington University School of Medicine, 2016
  • Machine Learning and Intelligence School, Microsoft Research, 2015
  • Yandex school of Data Analysis Conference, Yandex, 2014
  • Participated in various conferences on Ruby On Rails as a company representative and a speaker.

Научное руководство

2 магистерские диссертации были успешно защищены под руководством Олега.

Проекты

  • Автоматическое построение диаграмм Исикавы для эпигенетических данных
  • ChipQuery - поиск и анализ публичных баз данных по эпигенетике
  • Полуавтоматический инструмент для поиска пиков
  • JBR - многоцелевой геномный браузер, с возможностью поиска пиков, множественных позиций итд.
  • Основной исследовательский проект — Aging project, который ведется совместно с лабораторией Артемова.
  • CMeth Завершен
    CMeth - это инструмент для сравнения и анализа данных полногеномного бисульфитного секвенирования

Публикации

  • BioLabs Руководитель группы, Исследователь